Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCFC2P16383 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms