Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRFP11831 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFP11831 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFP11831 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFP11831 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFP11831 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFP11831 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFP11831 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFP11831 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFP11831 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFP11831 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRFP11831 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRFP11831 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRFP11831 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFP11831 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFP11831 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFP11831 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFP11831 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms