Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP3P10745 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP3P10745 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP3P10745 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP3P10745 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP3P10745 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBP3P10745 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms