Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00032P0C843 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms