Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms