Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms