Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRCP08575 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms