Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP1O94782 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP1O94782 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP1O94782 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP1O94782 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP1O94782 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP1O94782 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP1O94782 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP1O94782 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP1O94782 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP1O94782 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP1O94782 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP1O94782 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP1O94782 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP1O94782 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP1O94782 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms