Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sigmar1O55242 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sigmar1O55242 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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