Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms