Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA1C9JL84 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms