Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms