Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdccag3A2AIW0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms