Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YVX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YVX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YVX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YVX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YVX5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms