Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GY48 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
V9GY48 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
V9GY48 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
V9GY48 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GY48 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GY48 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GY48 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GY48 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GY48 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GY48 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
V9GY48 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
V9GY48 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
V9GY48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GY48 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms