Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1Q9Y3L3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms