Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PHF8Q9UPP1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms