Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RCAN3Q9UKA8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RCAN3Q9UKA8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms