Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms