Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms