Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXXC1Q9P0U4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms