Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF12Q9NZN5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms