Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAF1Q9H7N4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAF1Q9H7N4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms