Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOBPQ9H2D6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms