Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms