Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRC3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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