Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCD2Q9BXW9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
FANCD2Q9BXW9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC38■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
FANCD2Q9BXW9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms