Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms