Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms