Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms