Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR3Q96MK2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms