Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms