Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD3Q96ES6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms