Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRF1Q92994 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRF1Q92994 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms