Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNPO1Q92973 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNPO1Q92973 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms