Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP205Q92621 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms