Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms