Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms