Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms