Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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