Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY1Q8N5J2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY1Q8N5J2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms