Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Necab1Q8BG18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms