Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBR3Q6ZT12 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBR3Q6ZT12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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