Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP6Q6ZN66 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms