Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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