Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lcn3Q62471 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lcn3Q62471 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lcn3Q62471 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn3Q62471 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms