Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C10orf55Q5SWW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms