Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN2Q52LD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms