Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf22Q49AR2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf22Q49AR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms