Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm12888Q3UW77 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm12888Q3UW77 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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